จอน ฟาฟวโร ตั้งต้นอาชีพนักแสดงของเขา และนักเขียนที่มีความสามารถเปี่ยมล้น เห็นได้จากผลงานคอมเมดี้ร่วมสมัยเรื่อง Swingers ฟาฟวโรยังเดินหน้าต่อไปในการท้าทายตนเองด้วยโปรเจ็คที่ได้รับการคัดเลือกหลากหลาย มีผลงานกำกับภาพยนตร์เรื่องแรกใน Made จากสคริปท์ของตนเอง แสดงร่วมกับ วินซ์ วอห์น และ ฌอน 'พัฟฟี่' คอมบ์ส เขาแสดงคู่กับ แฟมเก้ แจนเซ็น ในหนังโรแมนติคคอมเมดี้ Love and Sex, เขียนบทและกำกับการแสดงโดยวาเลอรี่ บรีแมน ในปี 2000 มีผลงานหักมุมอาชีพการแสดงในเรื่องราวของแชมเปี้ยนเฮฟวี่เวทมืออาชีพ ร็อกกี้ มาร์ซีอาโน ในหนังอัตถชีวประวัติของโชว์ไทม์ เรื่อง Marciano เขียนบทและกำกับการแสดงโดย ชาร์ลส ววิงก์เลอร์ และอำนวยการสร้างโดย เออวิน วิงก์เลอร์ อละร็อบ โคแวน
ผลงานภาพยนตร์สร้างชื่อของฟาฟวโร ได้แก่ Very Bad Things แสดงคู่กับคริสเตียน สเลเตอร์ และคาเมรอน ดิแอซ และ The Replacements นำแสดงโดย คีอานู รีฟ เขายังร่วมแสดงในหนังโศกนาฎกรรมระทึกขวัญเรื่องฮิต Deep Impact กำกับการแสดงโดย มีมี่ เลเดอร์
จากประสบการณ์ส่วนตัวของเขากับฮอลลีวู้ด ฟาฟวโรเขียนบท เตรียมงานและร่วมอำนายการสร้างในเรื่อง Swingers ซึ่งเป็นโปรเจ็คการแสดงของเพื่อนๆ และตัวเขาเอง ซึ่งสร้างจากทุนจำนวนน้อยนิด ภาพยนตร์เรื่องนี้ทำให้เกิดผลงานทำลายสถิติการจัดจำหน่ายโดย มิราแมกซ์ Swingers ได้รับคำชมจากทั้งนักวิจารณ์และผู้ชม ยังผลให้ The Chicago Film Critics Association เสนอชื่อของฟาฟวโรเป็น Most Promising Actor เมื่อปี 1997 ผลงานสร้างชื่อของเขาทางโทรทัศน์ ได้แก่ บทบาทในคอมเมดี้ยอดนิยม เรื่อง Friends และร่วมแสดงในซีซันพิเศษทาง HBO เรื่อง The Sopranos รับบทเป็นตัวเขาเอง
ฟาฟวโรทำงานมาแล้วทุกอย่าง ตั้งแต่ทำความสะอาดท่อระบายน้ำโรงรถ ในแถบเฮลส์ คิทเช่น ไปจนถึงทำงานกับบริษัทด้านวาณิชธนกิจในวอลล์สตรีท ก่อนที่จะตัดสินใจเป็นนักแสดงในที่สุด เขาย้ายไปยังชิคาโก้เพื่อทำงานในคอมเมดี้สด และละครเวทีสด สนับสนุนตนเองด้วยการเป็นนักวาดการ์ตูน ในช่วงนั้นเองที่เดวิด แอนส์พาว ได้เลือกให้ฟาฟวโรรับบทนำใน Rudy ซึ่งเป็นงานภาพยนตร์เรื่องแรกของเขา
