หนังเล่าเรื่องราวของนินจาตระกูล "อิงะ" และ "โคงะ" ในยุคโตกุกาว่า โอโบโระ (ยูกิเอะ นากามะ) หลานสาวของโอเกน หัวหน้านินจาตระกูลอิงะ เจนโนสุเกะ (โจ โอดากิริ) ลูกชายของดันโจ โคงะ หัวหน้าตระกูลโคงะผู้ทรงอำนาจ ทั้งสองตระกูลอาศัยอยู่ในหุบเขาและฝึกวิทยายุทธจนมีวิชาเหนือมนุษย์ ทั้งสองตระกูลมีความแค้นต่อกันมายาวนานหลายศตวรรษ วันหนึ่งโชกุนเทนกาอิเห็นว่านินจาเป็นอุปสรรคต่อแผนการยึดอำนาจของเขาจึงคิดกำจัดนินจาให้หมดไปจากญี่ปุ่น เทนกาอิจัดการประลองยุทธระหว่างนินจาสองตระกูลนี้ขึ้น โดยให้แต่ละตระกูลส่งตัวแทนมา 5 คนเพื่อสู้กัน แต่การประลองครั้งนี้ไม่ใช่การประมือกันฉันท์มิตร หากเป็นการประลองเพื่อล้างตระกูล และการดวลครั้งนี้ก็ไม่ใช่การต่อสู้ของคนธรรมดา แต่เป็นการพบกันของนินจาที่มีวิชาเหนือมนุษย์ ไม่ว่าจะเป็น คิซารากิ ที่สามารถเปลี่ยนหน้าได้, ยาชามารุ ที่ยืดแขนขาได้, คาเกโร่ ที่ปล่อยพิษได้ หรือ ยากุชิจิ ที่มีตาวิเศษมองเห็นทุกอย่าง
ทว่า... อะไรจะเกิดขึ้นเมื่อ โอโบโระ และ เจนโนสุเกะ หนุ่มสาวจากสองตระกูลตกหลุมรักกัน และดิ้นรนเพื่อให้ได้มาซึ่งสันติภาพ ไม่ใช่สงคราม!
