การผจญภัยครั้งใหม่ ภาคใหม่ ตอนใหม่ในครั้งนี้ จะพาคุณย้อนกลับไปในดินแดนทะเลทรายทางเซ้าท์อีสต์ ในปี 1957 ช่วงสงครามเย็น เมื่ออินดี้ (แฮร์ริสัน ฟอร์ด) และเพื่อนซี้ แมค (เรย์ วินสโตน) ซึ่งเกือบจะหนีไม่รอดจากกองกำลังของโซเวียตที่ตั้งอยู่ในพื้นที่ห่างไกล และเมื่อหนีเสือกลับมาถึงบ้าน สถานการณ์กลับยิ่งร้ายกว่า เพราะงานที่มาร์แชล คอลเลจก็ถูกคำสั่งเบื้องบนที่บังคับให้คณบดี ซึ่งเป็นเพื่อนของเขาเอง ต้องเซ็นชื่อเชิญเขาออกจากงาน อันเนื่องมาจากเหตุการณ์ที่เพิ่งผ่านมา
ต่อมาอินดี้ได้พบกับเด็กหนุ่มชื่อ มัตต์ (ไชอา ลาบัฟ) เพื่อออกตาหาสมบัติล้ำค่าทางโบราณคดีที่ใครๆก็สนใจ นั่นคือ กะโหลกแก้วแห่งอเคเทอร์ วัตถุโบราณในตำนานอันน่าพิศวง ลึกลับ และน่าสะพรึงกลัว แต่เมื่อคู่หูต่างวัย อินดี้ และ มัตต์ ตามล่าหาสมบัติไปถึงเปรู ดินแดนแห่งขุมสมบัติโบราณ ที่ร่ำลือกันว่าเป็นดินแดนแห่งทองคำ พวกเขาก็พบกับเพื่อนร่วมทางที่ไม่ได้รับเชิญ พวกสายลับโซเวียตที่นำทีมโดยสาวสวยผู้โหดเหี้ยมเลือดเย็น อิริน่า สปัลโก (เคท บลันเชตต์) ซึ่งออกตามหากะโหลกแก้วอย่างพลิกแผ่นดิน ด้วยความเชื่อที่ว่ามันจะช่วยให้โซเวียตครองโลกได้ อินดี้ และ มัตต์ พร้อมด้วยพลพรรคหน้าคุ้น จึงต้องหาทางหนีจากพวกโซเวียตและตามหากะโหลกแก้วให้พบ เพื่อเก็บรักษามันให้พ้นจากเงื้อมมือพวกประสงค์ร้าย
