เรื่องย่อ
หลังหลบภัยจากโลกมนุษย์ไปนานหลายปี เหล่าพี่น้องนินจาเต่าก็เริ่มออกเดินทางเพื่อเอาชนะใจชาวนิวยอร์ก และเพื่อให้เป็นที่ยอมรับในฐานะวัยรุ่นทั่วไปผ่านการกระทำอันกล้าหาญ มนุษย์ผู้เป็นเพื่อนใหม่ของพวกเขา เอพริล โอนีล ได้ช่วยพวกเขาจัดการกับกลุ่มอาชญากรสุดฉาว แต่ไม่นานพวกเขาก็ได้เข้าไปพัวพันกับเรื่องโกลาหลที่ยากจะจัดการ เมื่อกองทัพมนุษย์กลายพันธุ์ถูกปลดปล่อยออกมา
