เมืองบังบด เมืองที่พญานาคปกปักษ์รักษาอยู่ แพรทองถูกเหล่าเด็กพญานาคขับไล่ เนื่องจากถูกมองว่าเป็น ปีศาจงูเพราะเป็นลูกมนุษย์ครึ่งพญานาค แต่เมื่อสุริยคราสเกิดขึ้น แพรทองในวัยเด็ก ก็สำแดงเดชให้รู้ว่า แพรทองคือ พญานาค ที่เป็นนางพญา เจ้าแห่งพญานาค เจ้าแม่ "นาคี"
จังหวัดหนองคาย อติวัฐ ศรีบดินทร์ หนุ่มวัย 22 ปี (ธนากร เสียงเพลิน) ลูกชายนักธุรกิจใหญ่ของประเทศไทย เดินทางมาคำชะโนด ด้วยความเชื่อตามความฝันจึงอยากมาเห็นด้วยตาสักครั้ง โดยมี อติพัน (น้องชาย อติวัฐ)และเพื่อน ๆ ร่วมเดินทางมาด้วย เมื่อมาถึงคำชะโนด อติวัฐ รู้สึกเหมือนเคยมาตั้งแต่ก่อนที่จะมีสิ่งปลูกสร้างจะเกิด จึงบอกเล่าให้ ดนุรุจเพื่อนรุ่นพี่ เป็นครูด้านโบราณคดีฟีง แต่ดนุรุจบอก อติวัฐ คิดไปเองว่าระลึกชาติได้ และที่คำชะโนดนั้น อติวัฐ ได้รับสร้อยคอ ไพลินนาคา จาก คนแปลกหน้า (นาคา แปลงร่าง) และในค่ำคืนนั้นเอง ขณะที่ทุกคนอยู่ในงานเลี้ยงของรีสอร์ท อติวัฐ ได้หายตัวไปอย่างลึกลับ
อติพัน ได้ปรึกษากับ เมฆ เจ้าของรีสอร์ท เพื่อนสนิทของอติวัฐเพื่อตามหาพี่ชายโดยมีกลุ่มเพื่อนช่วยเหลือ จนโดนมนต์นาคราชให้หลงเข้ามาใน เมืองบังบด ที่ซ่อนอยู่ในห้วงประตู 3 ภพของบ่อน้ำศักดิ์สิทธ์ คำชะโนด อติพันและเพื่อนต้องหนีจาก งูดำ (โขงดำ) อสูรร้ายแห่งบังบดที่เฝ้าประตูเมือง และหลบเข้าถ้านาคีจึงรอดพ้น.. เจ้าแห่งนาคราช อนันตนาคราช (จิตรคุปต์ ศิลป์ชัย) เห็นว่า อติวัฐ เป็นต้นเหตุให้มนุษย์เข้าเมืองบังบดทำให้มนต์นาคราชที่ปิดประตูไว้เสื่อมพลัง ด้วยการที่มนุษย์บุญบารมียังไม่ถึงความเป็นเทพ ก็จะไม่สามารถอยู่นครศักดิ์สิทธิ์ได้ จึงให้สร้างกลอุบายให้ นาคาแปลง นำสร้อยข้อมือไพลินนาคามาให้ อติวัฐ เพื่อทำให้พลังของ นาคี อ่อนกำลังและเผยร่างจริงจน อติวัฐ สามารถตัดใจหนีจาก นาคี ได้ และอุบายนั้นก็สำเร็จเมื่อนาคีการกลายร่าง อติวัฐได้หนีจากถ้ำจนได้พบกับ เมฆ,ดนุรุจ,อติพัน และเพื่อน ทั้งหมดพากัน หนีจากนาคีแต่ไม่สำเร็จ อติพัน,เมฆ,ดนุรุจและเพื่อนๆถูกส่งกลับมายัง ภพมนุษย์ โดยลืมทุกสิ่ง ในบังบด.. อติวัฐ กลับเข้าไปอยู่กับนาคีที่ถ้ำทองเหมือนเดิม เมื่ออนันตนาคราช รู้ถึงการณ์ว่า อติวัฐ ยังอยู่ จึงให้ เกราะนิมิต นำร่างอติวัฐ
ออกจากเมืองบังบด นาคีจึงโกรธและสำแดงฤทธิ์จนน้ำท่วมคำชะโนด แต่ความโกรธทำให้กระแสน้ำทำเกราะนิมิตแตก อติวัฐ สิ้นใจในน้ำโขง นาคี รักและบูชาความรักจึงเสียสละ แก้วพันปี ที่เป็นบารมีสะสมให้แก่อติวัฐ จนนาคีกลายร่างเป็นพญานาค ต่อมา 10 ปีให้หลัง นาคศรีสุวรรณ (โสภาส ณ ตะกั่วทุ่ง) อดีตชาติอีกร่างของอติวัฐ นำ สร้อยคอไพลินนาคา มาให้อติวัฐอีกครั้ง เพื่อ นางพญานาคีและมนุษย์จะอยู่ร่วมกันได้ ใน นครบังบด
